目前，南县辖9个建制镇、3个乡、391个村委会、55个居委会，县治设南洲镇。9个建制镇分别为南洲镇、茅草街镇、三仙湖镇、武圣宫镇、明山头镇、厂窖镇、华阁镇、青树嘴镇、麻河口镇。3个乡分别为乌嘴乡、中鱼口乡、浪拔湖乡。
      以澧水和藕池河东支划分为三片：河东片，华阁镇、青树嘴镇、明山头镇、乌嘴乡。河中片：南洲镇、茅草街镇、三仙湖镇、中鱼口乡、浪拔湖乡、 麻河口镇。河西片：武圣宫镇、厂窖镇。